Taikoma finansinės atskaitomybės sistema yra taisyklių rinkinys, naudojamas kaip gairės rengiant finansinę atskaitomybę. Naudojama sistema paprastai grindžiama verslo rūšimi ir jos buvimo vieta, taip pat taikomais įstatymais. Pavyzdžiui, Jungtinėse Amerikos Valstijose esančiai įmonei taikytina finansinės atskaitomybės sistema būtų visuotinai priimti apskaitos principai, o daugumoje kitų šalių taikytini tarptautiniai finansinės atskaitomybės standartai.