Specialieji žurnalai yra visi apskaitos žurnalai, išskyrus bendrąjį žurnalą. Šie žurnalai naudojami įrašyti tam tikros rūšies didelės apimties informaciją, kuri priešingu atveju būtų įrašoma į didžiąją knygą ir užgožtų ją. Bendra šių žurnalų suma periodiškai pervedama į didžiąją knygą santraukos forma.
Šiuose žurnaluose operacijos įrašomos chronologine tvarka, kad būtų lengviau tirti operacijas. Specialių žurnalų pavyzdžiai:
- Kasos pajamų žurnalas
- Grynųjų pinigų išmokėjimo žurnalas
- Darbo užmokesčio žurnalas
- Pirkinių žurnalas
- Pardavimų žurnalas