Esminis trūkumas atsiranda tada, kai nustatoma, kad vidaus finansinės atskaitomybės kontrolė yra neveiksminga. Kai yra pagrįsta tikimybė, kad dėl neveiksmingos kontrolės gali atsirasti reikšmingas neteisingas ūkio subjekto finansinių ataskaitų pateikimas, tai laikoma reikšmingu trūkumu. Kai auditoriai nustato reikšmingą trūkumą, jie turi apie tai pranešti audito komitetui. Tikėtina, kad audito komitetas darys spaudimą vadovybei kuo greičiau ištaisyti nustatytą problemą.